Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H7

Slc45a3, Solute carrier family 45 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a3Q8K0H7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a3Q8K0H7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a3Q8K0H7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a3Q8K0H7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a3Q8K0H7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a3Q8K0H7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a3Q8K0H7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc45a3Q8K0H7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms