Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms