Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms