Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Rab11fip3Q8CHD8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
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Rab11fip3Q8CHD8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Rab11fip3Q8CHD8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Rab11fip3Q8CHD8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Rab11fip3Q8CHD8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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