Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms