Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Usp27Q8CEG8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Usp27Q8CEG8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Usp27Q8CEG8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Usp27Q8CEG8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Usp27Q8CEG8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Usp27Q8CEG8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Usp27Q8CEG8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Usp27Q8CEG8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Usp27Q8CEG8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms