Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms