Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
9030612E09RikQ8CE20 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms