Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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