Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
4930507D05RikQ8C9C9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms