Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms