Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ccdc113Q8C5T8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ccdc113Q8C5T8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ccdc113Q8C5T8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ccdc113Q8C5T8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ccdc113Q8C5T8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ccdc113Q8C5T8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ccdc113Q8C5T8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ccdc113Q8C5T8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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