Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms