Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac7Q8C2B3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
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