Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa22Q8C1N8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms