Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms