Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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