Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tubgcp5Q8BKN5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tubgcp5Q8BKN5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tubgcp5Q8BKN5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tubgcp5Q8BKN5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tubgcp5Q8BKN5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tubgcp5Q8BKN5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tubgcp5Q8BKN5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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