Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms