Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms