Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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Ubash3bQ8BGG7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ubash3bQ8BGG7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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