Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8BGC1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8BGC1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms