Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms