Protein–RNA interactions for Protein: Q810I2

Trim50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim50Q810I2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim50Q810I2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms