Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms