Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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