Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms