Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms