Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms