Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms