Protein–RNA interactions for Protein: Q7M750

Opalin, Opalin, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OpalinQ7M750 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpalinQ7M750 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OpalinQ7M750 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms