Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox11Q7M6Y2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms