Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms