Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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