Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms