Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms