Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6GQU0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6GQU0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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