Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms