Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Pkp4Q68FH0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Pkp4Q68FH0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Pkp4Q68FH0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Pkp4Q68FH0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Pkp4Q68FH0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Pkp4Q68FH0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Pkp4Q68FH0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Pkp4Q68FH0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Pkp4Q68FH0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Pkp4Q68FH0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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