Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PtprdQ64487 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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PtprdQ64487 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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