Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms