Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms