Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms