Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd1Q62101 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms