Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TmpoQ61033 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TmpoQ61033 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms