Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms