Protein–RNA interactions for Protein: Q60864

Stip1, Stress-induced-phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stip1Q60864 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stip1Q60864 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms