Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms