Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms