Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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